Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms