Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms