Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms