Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPOP42166 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms