Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms