Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms