Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OTX2P32243 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OTX2P32243 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OTX2P32243 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OTX2P32243 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OTX2P32243 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OTX2P32243 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OTX2P32243 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
OTX2P32243 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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