Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CTSSP25774 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CTSSP25774 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CTSSP25774 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CTSSP25774 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSSP25774 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSSP25774 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSSP25774 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSSP25774 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSSP25774 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSSP25774 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSSP25774 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTSSP25774 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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