Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PTPRBP23467 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PTPRBP23467 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PTPRBP23467 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PTPRBP23467 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PTPRBP23467 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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PTPRBP23467 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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PTPRBP23467 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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