Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms