Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms