Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms