Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms