Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms