Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEU3Q9UQ49 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms