Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD1BQ9UPS6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms