Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTF2Q9UNY4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms