Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GIN1Q9NXP7 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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GIN1Q9NXP7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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GIN1Q9NXP7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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GIN1Q9NXP7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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