Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXQ1Q9C009 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FOXQ1Q9C009 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FOXQ1Q9C009 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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