Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms