Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms