Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms