Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms