Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms