Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms