Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms