Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF8Q3BBV2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms