Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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