Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLD3Q15054 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms