Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIXQ14938 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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