Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT33BQ14525 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT33BQ14525 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms