Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTK7Q13308 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTK7Q13308 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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