Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms