Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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