Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms