Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XPCQ01831 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms