Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms