Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms