Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms