Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRX1P78414 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRX1P78414 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms