Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC1P48995 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms