Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms