Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms