Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF1P10914 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF1P10914 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF1P10914 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF1P10914 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF1P10914 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms