Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOP08100 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms