Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIOO75962 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIOO75962 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIOO75962 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms