Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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