Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms