Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms