Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC17Q9NP64 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms